พืชชนิดนี้มีความโดดเด่นในเรื่องของน้ำยางในปริมาณสูง ซึ่งหลั่งออกมาจากเซลล์แลคโตเฟอร์รัสที่พบในเนื้อเยื่อส่วนใหญ่ของพืช เป็นสารสีขาวขุ่นและสามารถกัดกร่อนได้ น้ำยางประกอบด้วยเอ็นไซม์เอนโดเปปติเดสหลายชนิด ได้แก่ ปาเปน ไคโมปาเปน ประโยชน์ของมะละกอ ไกลซิลเอนโดเปปติเดส และคาริเคน ผลใช้เป็นยาได้หลายรูปแบบทั้งผลสุกและไม่สุก เนื้อหาทางโภชนาการ มะละกอขนาดกลางหนึ่งลูกเป็นคลังเก็บวิตามิน แร่ธาตุ สารต้านอนุมูลอิสระ และสารอาหารที่ดีต่อสุขภาพอื่นๆ ให้พลังงานประมาณ 120 แคลอรี